種屬：家貓（Felis catus）

基因組：3.1 billion bp

家貓會(huì)患上白血病也會(huì)受到免疫缺陷病毒的感染。為了更好的理解相關(guān)疾病，一個(gè)跨國(guó)科研團(tuán)隊(duì)測(cè)序了三只家貓的基因組并且進(jìn)行了注釋。這項(xiàng)研究為人們提供了一個(gè)新的貓科基因組瀏覽器——Genome Annotation Resource Fields（GARfield），其中包括血細(xì)胞的甲基化模式，以及兩萬(wàn)一千多個(gè)基因組注釋。

雖然此前人們發(fā)布過(guò)家貓的基因組，不過(guò)之前的*槍測(cè)序法覆蓋度太低，這項(xiàng)研究有助于*之前留下的缺口。此外，這項(xiàng)研究也有一些新發(fā)現(xiàn)，比如發(fā)現(xiàn)了新的逆轉(zhuǎn)錄病毒類似元件和單核苷酸突變。研究顯示，家貓基因組中約有55.7%是由重復(fù)序列組成的。

種屬：南極蠓（Belgica antarctica）

基因組：99 million bp

南極蠓是南極洲*一種*陸生的本土動(dòng)物，南極蠓測(cè)序揭向人們展示了環(huán)境對(duì)基因組結(jié)構(gòu)的限制。

不能飛的南極蠓是目前基因組zui小的昆蟲(chóng)，但它卻具有差不多13,500個(gè)功能基因。南極蠓基因組之所以那么小，是因?yàn)樗膬?nèi)含子很短，而且重復(fù)序列和轉(zhuǎn)座元件。

研究人員指出，在南極蠓中熱激蛋白、抗氧化酶、水通道蛋白的表達(dá)模式很*。正是這些適應(yīng)性改變幫助南極蠓在嚴(yán)酷的環(huán)境條件下生存下來(lái)，在那里干燥、嚴(yán)寒和高紫外線輻射是家常便飯。

“這是測(cè)序環(huán)境下的昆蟲(chóng)，為以后的比較研究奠定了基礎(chǔ)，”華盛頓州立大學(xué)的Joanna Kelley說(shuō)。“此前有研究認(rèn)為，有效群體大小越小基因組就越大，但我們看到南極蠓正好與此相反。”

種屬：新月彎孢霉（Curvularia lunata）

基因組：35.5 million base pairs

新月彎孢霉（Curvularia lunata）在我國(guó)造成了玉米作物的嚴(yán)重?fù)p失，日前上海交通大學(xué)的研究團(tuán)對(duì)這種真菌進(jìn)行了基因組測(cè)序。

研究人員通過(guò)比較發(fā)現(xiàn)，大約在兩千四百萬(wàn)年和五千萬(wàn)年前，C. lunata菌株CX-3和m118從另一種玉米病原體——Bipolaris maydis中分支出來(lái)，這三種致病菌現(xiàn)在仍然親緣緊密。

研究顯示，C. lunata菌株CX-3的基因組編碼了超過(guò)11,000個(gè)蛋白編碼基因，并且含有一些*的基因組島，這些區(qū)域可能對(duì)其毒性非常關(guān)鍵。CX-3中的轉(zhuǎn)座子元件比B. maydis或m118都要多。

研究人員比較了這三種致病菌的轉(zhuǎn)錄組，發(fā)現(xiàn)與次級(jí)代謝通路有關(guān)的基因存在表達(dá)差異。此外，CX-3的一些基因有助于真菌在壓力環(huán)境下的生存。這項(xiàng)研究可以幫助人們更好的理解C. lunata，并在此基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)更靈活的策略，控制其感染農(nóng)作物。