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上海滬宇生物科技有限公司

轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合蛋白質(zhì)組分析探索蠑螈再生奧秘

時(shí)間:2013-4-16閱讀:173
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來自德國及美國等處的研究人員針對基因組特別大,難以進(jìn)行全基因組測序的動物,提出了以轉(zhuǎn)錄組測序與蛋白質(zhì)組分析聯(lián)合以解析功能基因的策略,并以蠑螈進(jìn)行實(shí)驗(yàn),開辟了組織及器官再生研究的新思路。
然而蠑螈的基因組十分龐大,比人類基因組大十倍,要從頭獲得蠑螈的全基因組序列不容易。因此研究者們將目光轉(zhuǎn)向基因表達(dá)所產(chǎn)生的RNA,他們利用454新一代測序技術(shù)對蠑螈的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了研究。經(jīng)過從頭組裝N. viridescens的轉(zhuǎn)錄組,獲得了超過120,000個(gè)RNA轉(zhuǎn)錄本,約有15,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本編碼蛋白質(zhì),其中有826個(gè)轉(zhuǎn)錄本是蠑螈所*的。這些轉(zhuǎn)錄本中包含了不同器官所有再生階段的轉(zhuǎn)錄本,這些轉(zhuǎn)錄本中的一部分與其它生物相似。通過對蠑螈胚胎和幼體的心臟、四肢、眼睛、尾、肝臟、脾臟等組織中再生過程表達(dá)的蛋白的分離以及質(zhì)譜分析方法,對這些蛋白進(jìn)行分類及與轉(zhuǎn)錄本的比對。生物通
通過454新一代測序結(jié)果與質(zhì)譜技術(shù)的結(jié)合,發(fā)現(xiàn)了500多個(gè)其它生物中從未被發(fā)現(xiàn)的肽段,接下來會進(jìn)一步探索這些蛋白是否與再生能力相關(guān)。這項(xiàng)研究不僅為目前科學(xué)家們提供了兩棲類動物的基因數(shù)據(jù),更為基因組測序困難的動物研究,提出了一種新思路。
放免法試劑盒,動物血清,培養(yǎng)基價(jià)格

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