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揭示癌癥基因組啟動子突變數(shù)量顯著增加機制

時間:2016-4-15閱讀:355
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在一項新的研究中,來自澳大利亞新南威爾士大學(xué)(UNSW)的研究人員發(fā)現(xiàn)DNA修復(fù)在我們的基因組的重要區(qū)域受到損傷,從而對人體修復(fù)DNA損傷的能力提供新的認識。


修復(fù)諸如紫外線輻射和香煙煙霧之類的能夠?qū)е峦蛔兊沫h(huán)境因素對DNA造成的損傷是阻止我們的細胞發(fā)生癌變的一種基本過程。


在這項研究中,研究人員分析了來自14種癌癥類型的1161種腫瘤樣品的2千萬多個DNA突變。他們發(fā)現(xiàn)在許多癌癥類型中,尤其是皮膚癌,發(fā)生在被稱作“基因啟動子”的基因組區(qū)域中的DNA突變數(shù)量特別高。重要的是,這些DNA序列控制著基因如何表達,而這又會決定細胞的類型和功能。相關(guān)研究結(jié)果于2016年4月13日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標題為“Differential DNA repair underlies mutation hotspots at active promoters in cancer genomes”。


研究人員發(fā)現(xiàn)DNA突變數(shù)量在基因啟動子中增加的原因在于結(jié)合到DNA上控制基因表達的蛋白阻斷我們的細胞中的負責(zé)修復(fù)DNA損傷的多種修復(fù)系統(tǒng)中的一種。這種系統(tǒng)被稱作核苷酸切除修復(fù)(nucleotide excision repair, NER),是人細胞中多種DNA修復(fù)機制的一種,也是*的一種能夠修復(fù)紫外線造成的DNA損傷的機制。


論文通信作者、UNSW洛伊癌癥研究中心(Lowy Cancer Research Centre)生物信息學(xué)與整合基因組學(xué)研究小組Jason Wong博士說,這些結(jié)果提供了令人信服的證據(jù)表明在基因啟動子位點上的DNA突變增加是由于NER系統(tǒng)受到破壞而造成的。


Wong博士說,“這項研究還告訴我們,盡管人體具有良好的自我修復(fù)能力,但是當(dāng)我們持續(xù)遭受諸如紫外線和香煙煙霧之類的誘變劑導(dǎo)致的DNA損傷時,我們的基因組中的某些區(qū)域并不能夠得到很好的修復(fù)。”


“通過主動地避免接觸這些有害的環(huán)境因素,我們能夠讓在我們的身體中能夠?qū)е掳┌Y的DNA突變發(fā)生數(shù)量zui小化。”


在上,科學(xué)家們在此之前僅僅在端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(omerase reverse transcriptase, TERT)基因上鑒定出一種確切性地導(dǎo)致癌癥的啟動子突變。


Wong博士說,“我們的研究強調(diào)了還需要進一步研究基因啟動子突變在癌癥發(fā)展中的作用。”


 “這可能zui終幫助醫(yī)生確定為什么某些癌癥產(chǎn)生[基因啟動子突變],從而能夠讓他們更早地診斷癌癥和為病人選擇更有針對性的治療方法。”


論文共同作者、血液專家、UNSW副教授John Pimanda說,“這些發(fā)現(xiàn)非常令人印象深刻,這是因為它們揭示出僅僅通過提出恰當(dāng)?shù)膯栴},就可使用現(xiàn)有的和公開獲得的‘大數(shù)據(jù)’[獲得發(fā)現(xiàn)]。”


“我們并不需要花費時間和金錢招募病人、研究他們的癌癥并對他們的癌癥基因組進行測序。對研究人員而言,所有這些數(shù)據(jù)可在公共數(shù)據(jù)共享平臺上獲得。”


Pimanda 說,“這項研究強調(diào)了對生物信息學(xué)與基因組學(xué)研究進行投資能夠獲得回報。”來源:生物谷

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