黃京飛等類物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)合機(jī)制差異研究獲進(jìn)展

【資料簡介】

黃京飛等類物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)合機(jī)制差異研究獲進(jìn)展
         近日，雜志PLoS One在線刊登了中科院昆明動物研究所研究人員的研究成果“Retinoid-Binding Proteins: Similar Protein Architectures Bind Similar Ligands via Compley Different Ways，”，文章中，研究者在類物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)合機(jī)制差異研究中獲進(jìn)展。

在進(jìn)化過程中，相似的蛋白結(jié)構(gòu)可以用*不同的方式結(jié)合相同的配體。類轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白就是一個很好的例子。雖然他們結(jié)合相似的配體（，），配體的結(jié)合機(jī)制卻差別很大：在同一個家族和細(xì)胞位置的蛋白中配體結(jié)合方向相同；不同家族和細(xì)胞位置蛋白中配體結(jié)合方向相反。

在FABP家族中，CRBPs和CRABPs的配體都是β紫羅酮環(huán)指向轉(zhuǎn)脂蛋白疏水桶的內(nèi)部，而不飽和脂肪酸鏈指向溶液的方向。而在RBP家族RBP和ERABP蛋白中，配體方向剛好相反。結(jié)構(gòu)比對和序列比對發(fā)現(xiàn)，每個蛋白的配體連接位點(diǎn)非常保守。但是不同蛋白間配體結(jié)合位置發(fā)生了改變，并且和配體連接的氨基酸在不同蛋白中都不保守。

中科院昆明動物研究所黃京飛課題組張玉茹博士和趙玉琦博士運(yùn)用生物信息學(xué)和分子動力學(xué)模擬的方法，詳盡解釋了這種生物學(xué)現(xiàn)象并進(jìn)一步提出了類物質(zhì)在生物體內(nèi)可能的轉(zhuǎn)運(yùn)模型。（